[igraph] plot color with dendrogram

[Laurette Chardon]

Hi,

I'm using igraph recently with python on a debian system.

I succeded in creating a dendrogram and plot it :

comms = G.community_walktrap()

igraph.plot(comms,  mot+"-walktrap.svg")

But i don't see how to colorize it.

I tried :

comms2=comms.as_clustering(n=5)

igraph.plot(comms2,  mot+"-walktrap.svg",mark_groups = True)

It works but it's not a dendrogram because comms and comms2 are differents objects :

type(comms) -> <class 'igraph.clustering.VertexDendrogram'>

type(comms2) ->  <class 'igraph.clustering.VertexClustering'>

So i tried :

G1,G2,G3,G4,G5=comms2.subgraphs()
dict={}
dict['red']=G1.get_edgelist()
dict['green']=G2.get_edgelist()
dict['blue']=G3.get_edgelist()
dict['yellow']=G4.get_edgelist()
dict['magenta']=G5.get_edgelist()

and :

igraph.plot(comms,  mot+"-walktrap.svg",mark_groups = dict)

but the plot still is black and white ...

Any idea ?

Thanks for your help

best,

L Chardon

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Laurette CHARDON Ingénieure de Recherche informatique Service : +33(0)2 31 56 57 37 Bâtiment N3 - Sous-sol - porte SA S13 - Esplanade de la Paix CS 14032- 14032 CAEN Cedex 5 www.crisco.unicaen.fr Faites un geste pour l'environnement, n'imprimez ce mail que si nécessaire

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