[igraph] Coclustering in igraph

[Mona Jalal]

I am feeding the sparse matrix m to the cocluster function and I receive the 
following message. Do you know how I can feed this sparse matrix to the 
cocluster function or are there any other type of coclustering function in 
igraph?

> out<-cocluster(m,datatype="binary",nbcocluster=c(2,3))
Error in cocluster(m, datatype = "binary", nbcocluster = c(2, 3)) : 
 Data should be matrix.



73 x 15 sparse Matrix of class "dgCMatrix"
 
 [1,] 1 1 . . . . . . . . . . . . .
 [2,] . 1 1 . . . . . . . . . . . .
 [3,] 1 . . . 1 . . . . . . . . . .
 [4,] . 1 . . 1 . . . . . . . . . .
 [5,] . . 1 . 1 . . . . . . . . . .
 [6,] . . . 1 1 . . . . . . . . . .
 [7,] 1 . . . . 1 . . . . . . . . .
 [8,] . . . 1 . 1 . . . . . . . . .
 [9,] 1 . . . . . 1 . . . . . . . .
[10,] . 1 . . . . 1 . . . . . . . .
[11,] . . 1 . . . 1 . . . . . . . .
[12,] . . . . . 1 1 . . . . . . . .
[13,] 1 . . . . . . 1 . . . . . . .
[14,] . . 1 . . . . 1 . . . . . . .
[15,] . . . 1 . . . 1 . . . . . . .
[16,] . . . . 1 . . 1 . . . . . . .
[17,] . . . . . 1 . 1 . . . . . . .
[18,] . . . . . . 1 1 . . . . . . .
[19,] 1 . . . . . . . 1 . . . . . .
[20,] . . . 1 . . . . 1 . . . . . .
[21,] . . . . 1 . . . 1 . . . . . .
[22,] . . . . . 1 . . 1 . . . . . .
[23,] . . . . . . 1 . 1 . . . . . .
[24,] . . . . . . . 1 1 . . . . . .
[25,] 1 . . . . . . . . 1 . . . . .
[26,] . 1 . . . . . . . 1 . . . . .
[27,] . . 1 . . . . . . 1 . . . . .
[28,] . . . . 1 . . . . 1 . . . . .
[29,] . . . . . . 1 . . 1 . . . . .
[30,] . . . . . . . 1 . 1 . . . . .
[31,] . . . . . . . . 1 1 . . . . .
[32,] . . 1 . . . . . . . 1 . . . .
[33,] . . . 1 . . . . . . 1 . . . .
[34,] . . . . 1 . . . . . 1 . . . .
[35,] . . . . . 1 . . . . 1 . . . .
[36,] . . . . . . . 1 . . 1 . . . .
[37,] . . . . . . . . 1 . 1 . . . .
[38,] . 1 . . . . . . . . . 1 . . .
[39,] . . 1 . . . . . . . . 1 . . .
[40,] . . . 1 . . . . . . . 1 . . .
[41,] . . . . 1 . . . . . . 1 . . .
[42,] . . . . . 1 . . . . . 1 . . .
[43,] . . . . . . 1 . . . . 1 . . .
[44,] . . . . . . . 1 . . . 1 . . .
[45,] . . . . . . . . 1 . . 1 . . .
[46,] . . . . . . . . . . 1 1 . . .
[47,] 1 . . . . . . . . . . . 1 . .
[48,] . 1 . . . . . . . . . . 1 . .
[49,] . . 1 . . . . . . . . . 1 . .
[50,] . . . 1 . . . . . . . . 1 . .
[51,] . . . . . 1 . . . . . . 1 . .
[52,] . . . . . . 1 . . . . . 1 . .
[53,] . . . . . . . . 1 . . . 1 . .
[54,] . . . . . . . . . 1 . . 1 . .
[55,] . . . . . . . . . . 1 . 1 . .
[56,] 1 . . . . . . . . . . . . 1 .
[57,] . 1 . . . . . . . . . . . 1 .
[58,] . . 1 . . . . . . . . . . 1 .
[59,] . . . 1 . . . . . . . . . 1 .
[60,] . . . . . 1 . . . . . . . 1 .
[61,] . . . . . . . 1 . . . . . 1 .
[62,] . . . . . . . . . 1 . . . 1 .
[63,] . . . . . . . . . . 1 . . 1 .
[64,] . . . . . . . . . . . . 1 1 .
[65,] . 1 . . . . . . . . . . . . 1
[66,] . . . 1 . . . . . . . . . . 1
[67,] . . . . 1 . . . . . . . . . 1
[68,] . . . . . 1 . . . . . . . . 1
[69,] . . . . . . 1 . . . . . . . 1
[70,] . . . . . . . 1 . . . . . . 1
[71,] . . . . . . . . . . 1 . . . 1
[72,] . . . . . . . . . . . . 1 . 1
[73,] . . . . . . . . . . . . . 1 1





You can visit the following post for more info:
http://stackoverflow.com/questions/21689734/creating-the-node-edge-triangle-adjacency-graph-in-python-r


Thanks a lot,
Mona.