bug#70064: Error when loading r-sf and other spatial packages (gdal related)

[Javier Vaquero Martínez]

Dear guix community,

I am quite new to Guix so I apologize if I am doing something wrong.

I added channel guix-cran to get R packages. I installed r-sf r-terra, and other packages. However, I cannot load them in R.

Here, at the end of the message I show and example with r-rgdal but same thing happens with r-sf or r-terra.

Am I doing something wrong? Can you reproduce the bug?

Regards,

Javier.

$ guix shell r r-rgdal -- R -e "library(rgdal)"

R version 4.3.3 (2024-02-29) -- "Angel Food Cake"
Copyright (C) 2024 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)

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> library(rgdal)
Loading required package: sp
Error: package or namespace load failed for ‘rgdal’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...):
 unable to load shared object '/gnu/store/xjs26gdxwj2149rzxmq1rfikbly2i1yr-r-rgdal-1.6-7/site-library/rgdal/libs/rgdal.so':
  /gnu/store/71kgqypidg2ksvwm84ccqjwyzai9ay1i-gdal-3.6.1/lib/libgdal.so.32: undefined symbol: GEOSConcaveHull_r

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